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Methyl Target

Methyl Target測序技術方案 

      甲基化是基因組中非常重要的表觀遺傳學標記信息,參與了包括基因調控、生物發育、疾病等眾多的生理和病理過程,在大多數癌癥中都廣泛發現甲基化水平的異常。除了對于全基因組甲基化水平的觀察與研究,對于眾多目的候選基因的甲基化水平的研究則是更為具有針對性和打樣品可行性的方案,但是由于傳統的Sanger測序通量和費用的限制,這一方案一直停留在較小的研究規模上。現在天昊生物結合目的區域富集和二代測序技術推出了自主研發的目的候選基因區域甲基化水平測序技術——Methyl TargetTM,這一技術不僅大大提高了數據通量,同時大幅度降低了研究費用。


技術優勢:

      檢測精度高:單堿基分辨率,精確分析每一個C堿基的甲基化狀態;

      效率高,耗時少:借助二代測序高通量測序平臺,對甲基化信息進行高效掃描;

      性價比高:相對于傳統Sanger測序方法,費用少。

      高質量的引物設計:運用公司的生物信息學平臺快速、高質量地設計每一個引物,保證每個區域的富集質量。

      高準確性:我們充分運用Miseq 2×300bp的測序長度和成熟的生物信息學分析手段,對每一個堿基進行分析矯正,保證每個堿基都能表達出最真實的甲基化信息。


技術路線

      1.DNA質檢:Nanodrop儀器定量結合凝膠電泳檢測。

      2.樣本要求:樣品需求量:≥1μg;樣品純度:OD260/280=1.7-2.0;樣本無明顯降解。

      3.文庫構建:Bisulfite Treatment——樣本目標片段多重PCR反應——相同樣本的多重PCR反應體系混合——樣本添加特異性標簽序列——定量后上機測序。

      4.上機測序:Illumina Miseq 2×300bp測序。

      5.生物信息學分析。



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